Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX1P48742 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX1P48742 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX1P48742 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX1P48742 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX1P48742 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX1P48742 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX1P48742 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX1P48742 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX1P48742 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX1P48742 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX1P48742 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX1P48742 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX1P48742 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX1P48742 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX1P48742 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX1P48742 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX1P48742 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX1P48742 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LHX1P48742 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX1P48742 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX1P48742 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX1P48742 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX1P48742 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX1P48742 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX1P48742 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX1P48742 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX1P48742 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX1P48742 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX1P48742 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX1P48742 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX1P48742 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX1P48742 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX1P48742 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX1P48742 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX1P48742 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX1P48742 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX1P48742 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX1P48742 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX1P48742 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX1P48742 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX1P48742 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX1P48742 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX1P48742 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX1P48742 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX1P48742 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX1P48742 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX1P48742 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX1P48742 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX1P48742 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX1P48742 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX1P48742 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX1P48742 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX1P48742 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX1P48742 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX1P48742 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX1P48742 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX1P48742 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX1P48742 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX1P48742 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX1P48742 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX1P48742 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX1P48742 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX1P48742 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX1P48742 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX1P48742 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX1P48742 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX1P48742 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX1P48742 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX1P48742 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX1P48742 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX1P48742 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX1P48742 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX1P48742 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX1P48742 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX1P48742 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX1P48742 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX1P48742 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX1P48742 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX1P48742 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX1P48742 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX1P48742 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX1P48742 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX1P48742 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX1P48742 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX1P48742 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX1P48742 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX1P48742 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX1P48742 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX1P48742 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX1P48742 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX1P48742 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX1P48742 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX1P48742 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX1P48742 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX1P48742 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX1P48742 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX1P48742 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX1P48742 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX1P48742 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms