Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRIP1P48552 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms