Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms