Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSFP46459 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSFP46459 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSFP46459 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSFP46459 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSFP46459 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSFP46459 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSFP46459 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSFP46459 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSFP46459 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSFP46459 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSFP46459 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSFP46459 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSFP46459 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSFP46459 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSFP46459 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSFP46459 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSFP46459 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSFP46459 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSFP46459 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NSFP46459 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSFP46459 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSFP46459 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSFP46459 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSFP46459 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSFP46459 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSFP46459 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSFP46459 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSFP46459 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSFP46459 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSFP46459 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSFP46459 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NSFP46459 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSFP46459 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSFP46459 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSFP46459 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSFP46459 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSFP46459 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSFP46459 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSFP46459 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSFP46459 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSFP46459 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSFP46459 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSFP46459 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSFP46459 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSFP46459 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSFP46459 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSFP46459 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSFP46459 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSFP46459 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSFP46459 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSFP46459 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSFP46459 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSFP46459 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSFP46459 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSFP46459 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSFP46459 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSFP46459 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSFP46459 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSFP46459 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSFP46459 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSFP46459 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSFP46459 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSFP46459 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NSFP46459 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSFP46459 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSFP46459 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSFP46459 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSFP46459 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSFP46459 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSFP46459 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSFP46459 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSFP46459 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NSFP46459 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSFP46459 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSFP46459 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NSFP46459 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSFP46459 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSFP46459 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSFP46459 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSFP46459 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSFP46459 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSFP46459 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms