Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP2P46087 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP2P46087 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP2P46087 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP2P46087 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP2P46087 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP2P46087 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP2P46087 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP2P46087 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP2P46087 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP2P46087 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP2P46087 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP2P46087 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP2P46087 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP2P46087 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP2P46087 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP2P46087 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP2P46087 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP2P46087 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP2P46087 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP2P46087 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP2P46087 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP2P46087 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP2P46087 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP2P46087 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP2P46087 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP2P46087 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP2P46087 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP2P46087 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP2P46087 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP2P46087 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP2P46087 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP2P46087 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP2P46087 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP2P46087 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP2P46087 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP2P46087 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP2P46087 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP2P46087 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP2P46087 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP2P46087 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP2P46087 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP2P46087 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP2P46087 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP2P46087 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP2P46087 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms