Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGER3P43115 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGER3P43115 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGER3P43115 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGER3P43115 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGER3P43115 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGER3P43115 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTGER3P43115 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGER3P43115 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGER3P43115 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTGER3P43115 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGER3P43115 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms