Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMPOP42166 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMPOP42166 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMPOP42166 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TMPOP42166 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMPOP42166 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMPOP42166 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMPOP42166 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMPOP42166 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMPOP42166 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMPOP42166 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TMPOP42166 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMPOP42166 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMPOP42166 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMPOP42166 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMPOP42166 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMPOP42166 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMPOP42166 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMPOP42166 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMPOP42166 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMPOP42166 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMPOP42166 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMPOP42166 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMPOP42166 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMPOP42166 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMPOP42166 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMPOP42166 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMPOP42166 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMPOP42166 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TMPOP42166 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TMPOP42166 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMPOP42166 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMPOP42166 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMPOP42166 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMPOP42166 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMPOP42166 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMPOP42166 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMPOP42166 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMPOP42166 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TMPOP42166 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMPOP42166 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMPOP42166 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMPOP42166 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMPOP42166 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMPOP42166 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMPOP42166 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMPOP42166 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMPOP42166 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMPOP42166 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMPOP42166 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMPOP42166 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMPOP42166 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TMPOP42166 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMPOP42166 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMPOP42166 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMPOP42166 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TMPOP42166 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMPOP42166 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMPOP42166 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMPOP42166 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMPOP42166 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMPOP42166 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMPOP42166 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMPOP42166 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMPOP42166 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMPOP42166 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TMPOP42166 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMPOP42166 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMPOP42166 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMPOP42166 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMPOP42166 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TMPOP42166 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMPOP42166 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMPOP42166 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMPOP42166 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMPOP42166 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMPOP42166 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMPOP42166 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TMPOP42166 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMPOP42166 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMPOP42166 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMPOP42166 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMPOP42166 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMPOP42166 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMPOP42166 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMPOP42166 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMPOP42166 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMPOP42166 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMPOP42166 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMPOP42166 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMPOP42166 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMPOP42166 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TMPOP42166 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMPOP42166 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMPOP42166 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TMPOP42166 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMPOP42166 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMPOP42166 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMPOP42166 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMPOP42166 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms