Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPHP41219 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPHP41219 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPHP41219 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPHP41219 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPHP41219 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPHP41219 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPHP41219 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPHP41219 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPHP41219 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPHP41219 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPHP41219 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPHP41219 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPHP41219 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPHP41219 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPHP41219 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPHP41219 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPHP41219 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPHP41219 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPHP41219 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPHP41219 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPHP41219 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPHP41219 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPHP41219 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPHP41219 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPHP41219 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPHP41219 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPHP41219 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPHP41219 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPHP41219 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPHP41219 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPHP41219 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPHP41219 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPHP41219 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPHP41219 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPHP41219 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPHP41219 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPHP41219 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPHP41219 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPHP41219 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPHP41219 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPHP41219 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPHP41219 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPHP41219 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPHP41219 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPHP41219 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPHP41219 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPHP41219 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPHP41219 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPHP41219 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPHP41219 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPHP41219 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPHP41219 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPHP41219 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPHP41219 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPHP41219 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPHP41219 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPHP41219 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPHP41219 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPHP41219 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPHP41219 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPHP41219 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPHP41219 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPHP41219 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPHP41219 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPHP41219 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPHP41219 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPHP41219 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPHP41219 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPHP41219 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPHP41219 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPHP41219 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPHP41219 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPHP41219 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPHP41219 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPHP41219 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPHP41219 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPHP41219 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPHP41219 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPHP41219 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPHP41219 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPHP41219 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPHP41219 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPHP41219 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPHP41219 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPHP41219 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPHP41219 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPHP41219 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPHP41219 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPHP41219 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPHP41219 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPHP41219 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPHP41219 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPHP41219 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPHP41219 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPHP41219 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPHP41219 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPHP41219 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPHP41219 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPHP41219 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms