Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTRLP40313 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTRLP40313 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTRLP40313 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTRLP40313 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTRLP40313 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTRLP40313 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTRLP40313 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTRLP40313 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTRLP40313 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTRLP40313 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTRLP40313 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTRLP40313 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTRLP40313 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTRLP40313 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTRLP40313 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTRLP40313 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTRLP40313 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTRLP40313 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTRLP40313 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTRLP40313 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTRLP40313 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTRLP40313 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTRLP40313 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTRLP40313 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTRLP40313 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTRLP40313 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTRLP40313 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTRLP40313 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTRLP40313 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTRLP40313 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTRLP40313 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTRLP40313 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTRLP40313 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTRLP40313 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTRLP40313 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTRLP40313 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTRLP40313 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTRLP40313 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTRLP40313 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTRLP40313 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTRLP40313 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTRLP40313 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTRLP40313 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTRLP40313 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTRLP40313 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTRLP40313 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTRLP40313 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTRLP40313 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTRLP40313 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTRLP40313 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTRLP40313 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTRLP40313 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTRLP40313 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTRLP40313 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTRLP40313 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTRLP40313 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTRLP40313 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTRLP40313 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTRLP40313 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTRLP40313 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTRLP40313 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTRLP40313 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTRLP40313 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTRLP40313 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTRLP40313 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTRLP40313 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTRLP40313 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTRLP40313 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTRLP40313 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTRLP40313 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTRLP40313 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTRLP40313 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTRLP40313 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTRLP40313 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTRLP40313 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTRLP40313 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTRLP40313 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTRLP40313 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTRLP40313 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTRLP40313 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTRLP40313 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTRLP40313 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTRLP40313 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTRLP40313 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTRLP40313 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTRLP40313 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTRLP40313 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTRLP40313 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms