Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA7P36544 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms