Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRIM23P36406 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRIM23P36406 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRIM23P36406 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRIM23P36406 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRIM23P36406 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRIM23P36406 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM23P36406 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms