Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FLT4P35916 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FLT4P35916 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FLT4P35916 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FLT4P35916 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FLT4P35916 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FLT4P35916 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FLT4P35916 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FLT4P35916 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FLT4P35916 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FLT4P35916 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FLT4P35916 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FLT4P35916 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FLT4P35916 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FLT4P35916 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FLT4P35916 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FLT4P35916 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FLT4P35916 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FLT4P35916 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FLT4P35916 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FLT4P35916 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FLT4P35916 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FLT4P35916 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FLT4P35916 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FLT4P35916 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FLT4P35916 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FLT4P35916 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FLT4P35916 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FLT4P35916 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FLT4P35916 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FLT4P35916 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FLT4P35916 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FLT4P35916 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FLT4P35916 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FLT4P35916 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FLT4P35916 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FLT4P35916 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FLT4P35916 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FLT4P35916 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FLT4P35916 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FLT4P35916 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FLT4P35916 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FLT4P35916 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FLT4P35916 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FLT4P35916 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FLT4P35916 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FLT4P35916 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FLT4P35916 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FLT4P35916 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FLT4P35916 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FLT4P35916 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FLT4P35916 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FLT4P35916 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FLT4P35916 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FLT4P35916 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FLT4P35916 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLT4P35916 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLT4P35916 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLT4P35916 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLT4P35916 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLT4P35916 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLT4P35916 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLT4P35916 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLT4P35916 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLT4P35916 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLT4P35916 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLT4P35916 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLT4P35916 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLT4P35916 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLT4P35916 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FLT4P35916 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FLT4P35916 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FLT4P35916 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FLT4P35916 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FLT4P35916 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FLT4P35916 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FLT4P35916 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FLT4P35916 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FLT4P35916 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FLT4P35916 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FLT4P35916 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FLT4P35916 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FLT4P35916 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FLT4P35916 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FLT4P35916 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FLT4P35916 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FLT4P35916 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FLT4P35916 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FLT4P35916 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FLT4P35916 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FLT4P35916 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FLT4P35916 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FLT4P35916 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FLT4P35916 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FLT4P35916 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FLT4P35916 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FLT4P35916 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FLT4P35916 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FLT4P35916 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FLT4P35916 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms