Protein–RNA interactions for Protein: P34077

NIC96, Nucleoporin NIC96, yeastyeast

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIC96P34077 YDR230WYDR230W 348 nt3.58□□□□□ -1.84
NIC96P34077 RPS8BYER102W 603 nt3.58□□□□□ -1.84
NIC96P34077 PEA2YER149C 1263 nt3.58□□□□□ -1.84
NIC96P34077 SPT4YGR063C 309 nt3.58□□□□□ -1.84
NIC96P34077 YHL026CYHL026C 948 nt3.58□□□□□ -1.84
NIC96P34077 LRP1YHR081W 555 nt3.58□□□□□ -1.84
NIC96P34077 SRL3YKR091W 741 nt3.58□□□□□ -1.84
NIC96P34077 YBL010CYBL010C 843 nt3.58□□□□□ -1.84
NIC96P34077 YNL181WYNL181W 1224 nt3.58□□□□□ -1.84
NIC96P34077 MEI5YPL121C 669 nt3.58□□□□□ -1.84
NIC96P34077 snR56snR56 88 nt3.57□□□□□ -1.84
NIC96P34077 DIT2YDR402C 1470 nt3.57□□□□□ -1.84
NIC96P34077 VMA8YEL051W 771 nt3.57□□□□□ -1.84
NIC96P34077 OSH3YHR073W 2991 nt3.57□□□□□ -1.84
NIC96P34077 SYS1YJL004C 612 nt3.57□□□□□ -1.84
NIC96P34077 YLR076CYLR076C 423 nt3.57□□□□□ -1.84
NIC96P34077 AIM4YBR194W 372 nt3.57□□□□□ -1.84
NIC96P34077 MDV1YJL112W 2145 nt3.56□□□□□ -1.84
NIC96P34077 NEL1YHR035W 1893 nt3.56□□□□□ -1.84
NIC96P34077 EAP1YKL204W 1899 nt3.56□□□□□ -1.84
NIC96P34077 RVS161YCR009C 798 nt3.56□□□□□ -1.84
NIC96P34077 HSP30YCR021C 999 nt3.56□□□□□ -1.84
NIC96P34077 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.56□□□□□ -1.84
NIC96P34077 TDA2YER071C 381 nt3.56□□□□□ -1.84
NIC96P34077 YHR213WYHR213W 597 nt3.56□□□□□ -1.84
NIC96P34077 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt3.56□□□□□ -1.84
NIC96P34077 YJR141WYJR141W 1044 nt3.56□□□□□ -1.84
NIC96P34077 YJR157WYJR157W 363 nt3.56□□□□□ -1.84
NIC96P34077 TDA8YAL064C-A 381 nt3.56□□□□□ -1.84
NIC96P34077 YAR062WYAR062W 597 nt3.56□□□□□ -1.84
NIC96P34077 ATP18YML081C-A 180 nt3.56□□□□□ -1.84
NIC96P34077 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt3.56□□□□□ -1.84
NIC96P34077 RCN2YOR220W 798 nt3.56□□□□□ -1.84
NIC96P34077 TGL3YMR313C 1929 nt3.56□□□□□ -1.84
NIC96P34077 APE2YKL157W 2859 nt3.56□□□□□ -1.84
NIC96P34077 SMC2YFR031C 3513 nt3.56□□□□□ -1.84
NIC96P34077 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt3.55□□□□□ -1.84
NIC96P34077 MTR4YJL050W 3222 nt3.55□□□□□ -1.84
NIC96P34077 SIZ1YDR409W 2715 nt3.55□□□□□ -1.84
NIC96P34077 SNA4YDL123W 423 nt3.55□□□□□ -1.84
NIC96P34077 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt3.55□□□□□ -1.84
NIC96P34077 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt3.55□□□□□ -1.84
NIC96P34077 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt3.55□□□□□ -1.84
NIC96P34077 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt3.55□□□□□ -1.84
NIC96P34077 RPS16AYMR143W 432 nt3.55□□□□□ -1.84
NIC96P34077 YBR051WYBR051W 351 nt3.55□□□□□ -1.84
NIC96P34077 NTC20YBR188C 423 nt3.55□□□□□ -1.84
NIC96P34077 YDR338CYDR338C 2088 nt3.55□□□□□ -1.84
NIC96P34077 ALA1YOR335C 2877 nt3.54□□□□□ -1.84
NIC96P34077 RNT1YMR239C 1416 nt3.54□□□□□ -1.84
NIC96P34077 JJJ1YNL227C 1773 nt3.54□□□□□ -1.84
NIC96P34077 YDL242WYDL242W 354 nt3.54□□□□□ -1.84
NIC96P34077 SLX9YGR081C 633 nt3.54□□□□□ -1.84
NIC96P34077 REC104YHR157W 549 nt3.54□□□□□ -1.84
NIC96P34077 SOD1YJR104C 465 nt3.54□□□□□ -1.84
NIC96P34077 RPC37YKR025W 849 nt3.54□□□□□ -1.84
NIC96P34077 YBR062CYBR062C 543 nt3.54□□□□□ -1.84
NIC96P34077 USA1YML029W 2517 nt3.54□□□□□ -1.84
NIC96P34077 NSP1YJL041W 2472 nt3.54□□□□□ -1.84
NIC96P34077 YLR352WYLR352W 2424 nt3.54□□□□□ -1.84
NIC96P34077 RPN3YER021W 1572 nt3.54□□□□□ -1.84
NIC96P34077 SWC4YGR002C 1431 nt3.53□□□□□ -1.84
NIC96P34077 snR84snR84 550 nt3.53□□□□□ -1.84
NIC96P34077 SEC53YFL045C 765 nt3.53□□□□□ -1.84
NIC96P34077 YJL086CYJL086C 369 nt3.53□□□□□ -1.84
NIC96P34077 YPT7YML001W 627 nt3.53□□□□□ -1.84
NIC96P34077 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.53□□□□□ -1.84
NIC96P34077 SRB4YER022W 2064 nt3.53□□□□□ -1.84
NIC96P34077 YER066C-AYER066C-A 501 nt3.52□□□□□ -1.85
NIC96P34077 YGL074CYGL074C 327 nt3.52□□□□□ -1.85
NIC96P34077 MTM1YGR257C 1101 nt3.52□□□□□ -1.85
NIC96P34077 YGR290WYGR290W 444 nt3.52□□□□□ -1.85
NIC96P34077 YJL119CYJL119C 324 nt3.52□□□□□ -1.85
NIC96P34077 LSM8YJR022W 330 nt3.52□□□□□ -1.85
NIC96P34077 MRP8YKL142W 660 nt3.52□□□□□ -1.85
NIC96P34077 YNL150WYNL150W 408 nt3.52□□□□□ -1.85
NIC96P34077 MSN1YOL116W 1149 nt3.52□□□□□ -1.85
NIC96P34077 PET123YOR158W 957 nt3.52□□□□□ -1.85
NIC96P34077 SSM4YIL030C 3960 nt3.52□□□□□ -1.85
NIC96P34077 STN1YDR082W 1485 nt3.52□□□□□ -1.85
NIC96P34077 SCY1YGL083W 2415 nt3.52□□□□□ -1.85
NIC96P34077 YNL193WYNL193W 1677 nt3.52□□□□□ -1.85
NIC96P34077 ATP22YDR350C 2055 nt3.51□□□□□ -1.85
NIC96P34077 JJJ2YJL162C 1752 nt3.51□□□□□ -1.85
NIC96P34077 KIN4YOR233W 2403 nt3.51□□□□□ -1.85
NIC96P34077 YCR001WYCR001W 315 nt3.51□□□□□ -1.85
NIC96P34077 NSA2YER126C 786 nt3.51□□□□□ -1.85
NIC96P34077 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.51□□□□□ -1.85
NIC96P34077 BET4YJL031C 984 nt3.51□□□□□ -1.85
NIC96P34077 RAD14YMR201C 1116 nt3.51□□□□□ -1.85
NIC96P34077 SFM1YOR021C 642 nt3.51□□□□□ -1.85
NIC96P34077 TPK2YPL203W 1143 nt3.51□□□□□ -1.85
NIC96P34077 ADY4YLR227C 1482 nt3.51□□□□□ -1.85
NIC96P34077 SPP382YLR424W 2127 nt3.5□□□□□ -1.85
NIC96P34077 LCB4YOR171C 1875 nt3.5□□□□□ -1.85
NIC96P34077 PCK1YKR097W 1650 nt3.5□□□□□ -1.85
NIC96P34077 NCS2YNL119W 1482 nt3.5□□□□□ -1.85
NIC96P34077 HMLALPHA2YCL067C 633 nt3.5□□□□□ -1.85
NIC96P34077 MATALPHA2YCR039C 633 nt3.5□□□□□ -1.85
NIC96P34077 FAD1YDL045C 921 nt3.5□□□□□ -1.85
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