Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCD1P33897 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms