Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ABCC1P33527 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ABCC1P33527 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ABCC1P33527 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ABCC1P33527 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ABCC1P33527 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ABCC1P33527 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ABCC1P33527 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ABCC1P33527 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ABCC1P33527 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ABCC1P33527 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ABCC1P33527 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ABCC1P33527 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
ABCC1P33527 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ABCC1P33527 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ABCC1P33527 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
ABCC1P33527 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
ABCC1P33527 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ABCC1P33527 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ABCC1P33527 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ABCC1P33527 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC1P33527 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms