Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG3P32926 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG3P32926 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG3P32926 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG3P32926 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG3P32926 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG3P32926 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG3P32926 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DSG3P32926 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DSG3P32926 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG3P32926 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG3P32926 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG3P32926 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG3P32926 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG3P32926 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG3P32926 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG3P32926 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG3P32926 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG3P32926 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG3P32926 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG3P32926 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG3P32926 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG3P32926 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG3P32926 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG3P32926 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG3P32926 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG3P32926 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG3P32926 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG3P32926 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG3P32926 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG3P32926 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG3P32926 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG3P32926 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG3P32926 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG3P32926 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG3P32926 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG3P32926 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG3P32926 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG3P32926 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG3P32926 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG3P32926 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG3P32926 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG3P32926 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG3P32926 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG3P32926 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG3P32926 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG3P32926 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG3P32926 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG3P32926 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG3P32926 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG3P32926 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG3P32926 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG3P32926 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG3P32926 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG3P32926 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG3P32926 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG3P32926 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG3P32926 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG3P32926 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG3P32926 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG3P32926 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG3P32926 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG3P32926 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG3P32926 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG3P32926 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG3P32926 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG3P32926 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG3P32926 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG3P32926 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG3P32926 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG3P32926 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG3P32926 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG3P32926 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG3P32926 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG3P32926 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG3P32926 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG3P32926 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG3P32926 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG3P32926 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG3P32926 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG3P32926 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG3P32926 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG3P32926 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG3P32926 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG3P32926 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG3P32926 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG3P32926 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG3P32926 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG3P32926 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG3P32926 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG3P32926 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG3P32926 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG3P32926 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG3P32926 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG3P32926 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG3P32926 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG3P32926 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG3P32926 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG3P32926 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG3P32926 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms