Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCKBRP32239 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms