Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCKARP32238 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCKARP32238 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCKARP32238 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCKARP32238 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCKARP32238 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCKARP32238 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCKARP32238 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCKARP32238 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCKARP32238 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCKARP32238 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCKARP32238 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCKARP32238 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCKARP32238 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCKARP32238 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCKARP32238 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCKARP32238 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCKARP32238 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCKARP32238 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCKARP32238 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCKARP32238 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCKARP32238 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCKARP32238 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCKARP32238 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCKARP32238 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCKARP32238 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCKARP32238 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCKARP32238 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCKARP32238 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCKARP32238 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCKARP32238 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCKARP32238 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCKARP32238 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCKARP32238 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCKARP32238 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCKARP32238 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCKARP32238 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCKARP32238 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCKARP32238 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCKARP32238 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCKARP32238 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCKARP32238 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCKARP32238 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCKARP32238 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCKARP32238 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCKARP32238 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCKARP32238 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCKARP32238 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCKARP32238 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCKARP32238 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCKARP32238 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCKARP32238 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCKARP32238 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCKARP32238 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCKARP32238 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCKARP32238 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCKARP32238 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCKARP32238 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCKARP32238 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCKARP32238 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCKARP32238 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCKARP32238 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCKARP32238 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCKARP32238 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCKARP32238 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCKARP32238 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCKARP32238 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCKARP32238 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCKARP32238 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCKARP32238 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCKARP32238 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCKARP32238 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCKARP32238 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCKARP32238 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCKARP32238 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms