Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXC13P31276 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms