Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms