Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXC9P31274 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXC9P31274 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms