Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPOP30536 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPOP30536 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPOP30536 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPOP30536 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPOP30536 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPOP30536 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPOP30536 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPOP30536 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPOP30536 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPOP30536 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPOP30536 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPOP30536 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPOP30536 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSPOP30536 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSPOP30536 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPOP30536 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms