Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBL1P28749 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBL1P28749 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBL1P28749 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBL1P28749 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBL1P28749 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBL1P28749 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBL1P28749 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBL1P28749 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBL1P28749 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBL1P28749 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBL1P28749 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBL1P28749 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBL1P28749 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBL1P28749 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBL1P28749 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBL1P28749 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBL1P28749 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBL1P28749 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBL1P28749 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBL1P28749 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBL1P28749 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBL1P28749 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBL1P28749 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBL1P28749 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBL1P28749 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBL1P28749 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBL1P28749 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBL1P28749 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBL1P28749 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBL1P28749 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBL1P28749 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBL1P28749 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBL1P28749 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBL1P28749 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBL1P28749 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBL1P28749 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBL1P28749 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBL1P28749 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBL1P28749 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RBL1P28749 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBL1P28749 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBL1P28749 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBL1P28749 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBL1P28749 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBL1P28749 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBL1P28749 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBL1P28749 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBL1P28749 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBL1P28749 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBL1P28749 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBL1P28749 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBL1P28749 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBL1P28749 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBL1P28749 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBL1P28749 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBL1P28749 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBL1P28749 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBL1P28749 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBL1P28749 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBL1P28749 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBL1P28749 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBL1P28749 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBL1P28749 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBL1P28749 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBL1P28749 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RBL1P28749 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBL1P28749 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBL1P28749 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBL1P28749 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBL1P28749 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBL1P28749 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBL1P28749 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBL1P28749 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBL1P28749 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RBL1P28749 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBL1P28749 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBL1P28749 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBL1P28749 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBL1P28749 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBL1P28749 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBL1P28749 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBL1P28749 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBL1P28749 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBL1P28749 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBL1P28749 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBL1P28749 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBL1P28749 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBL1P28749 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBL1P28749 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RBL1P28749 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBL1P28749 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RBL1P28749 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBL1P28749 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBL1P28749 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBL1P28749 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBL1P28749 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBL1P28749 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBL1P28749 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBL1P28749 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms