Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP1P28562 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP1P28562 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms