Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SSFA2P28290 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms