Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms