Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX1P22670 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX1P22670 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX1P22670 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX1P22670 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX1P22670 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX1P22670 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX1P22670 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX1P22670 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX1P22670 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX1P22670 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX1P22670 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX1P22670 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX1P22670 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX1P22670 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX1P22670 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX1P22670 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX1P22670 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX1P22670 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX1P22670 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX1P22670 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX1P22670 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX1P22670 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX1P22670 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX1P22670 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX1P22670 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX1P22670 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX1P22670 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX1P22670 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX1P22670 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX1P22670 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX1P22670 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX1P22670 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX1P22670 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX1P22670 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX1P22670 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX1P22670 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX1P22670 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX1P22670 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX1P22670 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX1P22670 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX1P22670 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX1P22670 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX1P22670 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX1P22670 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX1P22670 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX1P22670 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX1P22670 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX1P22670 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX1P22670 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX1P22670 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX1P22670 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX1P22670 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX1P22670 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX1P22670 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX1P22670 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX1P22670 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX1P22670 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX1P22670 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX1P22670 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX1P22670 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX1P22670 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX1P22670 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX1P22670 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX1P22670 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX1P22670 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX1P22670 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX1P22670 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX1P22670 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX1P22670 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX1P22670 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX1P22670 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX1P22670 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX1P22670 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX1P22670 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX1P22670 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX1P22670 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX1P22670 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX1P22670 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX1P22670 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX1P22670 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RFX1P22670 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX1P22670 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX1P22670 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX1P22670 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX1P22670 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX1P22670 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX1P22670 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX1P22670 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX1P22670 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX1P22670 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX1P22670 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX1P22670 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX1P22670 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX1P22670 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX1P22670 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX1P22670 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX1P22670 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX1P22670 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX1P22670 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms