Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL1P22362 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL1P22362 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL1P22362 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL1P22362 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL1P22362 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL1P22362 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL1P22362 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL1P22362 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL1P22362 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL1P22362 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL1P22362 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL1P22362 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL1P22362 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL1P22362 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL1P22362 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL1P22362 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL1P22362 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL1P22362 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL1P22362 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL1P22362 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL1P22362 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL1P22362 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL1P22362 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL1P22362 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL1P22362 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL1P22362 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL1P22362 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL1P22362 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL1P22362 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL1P22362 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL1P22362 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL1P22362 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL1P22362 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL1P22362 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL1P22362 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL1P22362 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL1P22362 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL1P22362 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCL1P22362 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL1P22362 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL1P22362 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL1P22362 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL1P22362 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL1P22362 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL1P22362 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL1P22362 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL1P22362 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL1P22362 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL1P22362 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL1P22362 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL1P22362 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL1P22362 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL1P22362 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL1P22362 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL1P22362 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL1P22362 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL1P22362 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL1P22362 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL1P22362 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL1P22362 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL1P22362 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL1P22362 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL1P22362 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL1P22362 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL1P22362 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL1P22362 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL1P22362 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL1P22362 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL1P22362 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL1P22362 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL1P22362 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL1P22362 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL1P22362 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL1P22362 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL1P22362 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL1P22362 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL1P22362 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL1P22362 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL1P22362 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL1P22362 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL1P22362 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL1P22362 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL1P22362 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL1P22362 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL1P22362 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL1P22362 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL1P22362 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL1P22362 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL1P22362 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL1P22362 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL1P22362 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL1P22362 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL1P22362 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL1P22362 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL1P22362 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL1P22362 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL1P22362 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL1P22362 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL1P22362 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms