Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCP2P22307 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCP2P22307 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCP2P22307 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCP2P22307 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCP2P22307 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCP2P22307 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCP2P22307 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCP2P22307 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCP2P22307 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCP2P22307 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCP2P22307 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCP2P22307 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCP2P22307 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCP2P22307 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCP2P22307 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCP2P22307 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCP2P22307 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCP2P22307 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCP2P22307 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCP2P22307 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCP2P22307 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCP2P22307 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCP2P22307 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCP2P22307 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCP2P22307 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCP2P22307 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCP2P22307 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCP2P22307 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCP2P22307 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCP2P22307 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCP2P22307 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCP2P22307 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCP2P22307 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCP2P22307 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCP2P22307 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCP2P22307 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCP2P22307 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCP2P22307 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCP2P22307 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCP2P22307 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCP2P22307 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCP2P22307 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCP2P22307 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCP2P22307 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCP2P22307 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCP2P22307 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCP2P22307 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCP2P22307 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCP2P22307 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCP2P22307 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCP2P22307 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCP2P22307 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCP2P22307 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCP2P22307 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCP2P22307 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCP2P22307 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCP2P22307 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCP2P22307 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCP2P22307 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SCP2P22307 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SCP2P22307 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCP2P22307 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCP2P22307 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCP2P22307 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCP2P22307 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCP2P22307 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCP2P22307 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCP2P22307 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCP2P22307 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCP2P22307 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCP2P22307 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCP2P22307 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCP2P22307 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCP2P22307 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCP2P22307 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCP2P22307 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCP2P22307 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCP2P22307 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCP2P22307 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCP2P22307 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCP2P22307 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCP2P22307 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCP2P22307 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCP2P22307 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCP2P22307 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCP2P22307 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCP2P22307 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCP2P22307 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCP2P22307 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCP2P22307 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCP2P22307 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCP2P22307 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCP2P22307 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCP2P22307 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCP2P22307 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCP2P22307 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCP2P22307 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCP2P22307 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCP2P22307 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms