Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1P21675 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1P21675 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1P21675 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1P21675 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1P21675 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1P21675 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1P21675 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1P21675 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1P21675 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1P21675 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1P21675 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1P21675 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1P21675 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1P21675 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1P21675 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1P21675 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1P21675 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1P21675 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1P21675 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1P21675 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1P21675 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1P21675 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1P21675 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAF1P21675 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1P21675 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1P21675 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1P21675 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1P21675 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1P21675 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAF1P21675 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TAF1P21675 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TAF1P21675 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TAF1P21675 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TAF1P21675 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TAF1P21675 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1P21675 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1P21675 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1P21675 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1P21675 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1P21675 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1P21675 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1P21675 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1P21675 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1P21675 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1P21675 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1P21675 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1P21675 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAF1P21675 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1P21675 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1P21675 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1P21675 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1P21675 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1P21675 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1P21675 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1P21675 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1P21675 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1P21675 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1P21675 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1P21675 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1P21675 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAF1P21675 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1P21675 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1P21675 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1P21675 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1P21675 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1P21675 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1P21675 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1P21675 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1P21675 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1P21675 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1P21675 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1P21675 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1P21675 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1P21675 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1P21675 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1P21675 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAF1P21675 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1P21675 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1P21675 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1P21675 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1P21675 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1P21675 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1P21675 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1P21675 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1P21675 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1P21675 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1P21675 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1P21675 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAF1P21675 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1P21675 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1P21675 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1P21675 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1P21675 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1P21675 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1P21675 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1P21675 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1P21675 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1P21675 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAF1P21675 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms