Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT1P21579 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT1P21579 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT1P21579 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT1P21579 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT1P21579 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT1P21579 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT1P21579 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT1P21579 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT1P21579 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT1P21579 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT1P21579 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT1P21579 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT1P21579 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT1P21579 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT1P21579 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT1P21579 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT1P21579 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT1P21579 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT1P21579 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT1P21579 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT1P21579 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT1P21579 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT1P21579 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT1P21579 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT1P21579 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT1P21579 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT1P21579 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT1P21579 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT1P21579 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT1P21579 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT1P21579 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT1P21579 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT1P21579 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT1P21579 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT1P21579 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT1P21579 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT1P21579 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT1P21579 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT1P21579 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT1P21579 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT1P21579 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT1P21579 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT1P21579 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT1P21579 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT1P21579 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT1P21579 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT1P21579 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT1P21579 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT1P21579 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT1P21579 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT1P21579 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT1P21579 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT1P21579 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT1P21579 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT1P21579 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT1P21579 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT1P21579 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT1P21579 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT1P21579 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT1P21579 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT1P21579 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT1P21579 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT1P21579 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT1P21579 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT1P21579 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT1P21579 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT1P21579 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT1P21579 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT1P21579 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT1P21579 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT1P21579 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT1P21579 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT1P21579 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT1P21579 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT1P21579 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT1P21579 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT1P21579 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT1P21579 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT1P21579 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT1P21579 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT1P21579 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT1P21579 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT1P21579 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT1P21579 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT1P21579 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT1P21579 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT1P21579 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT1P21579 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT1P21579 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT1P21579 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT1P21579 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT1P21579 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT1P21579 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT1P21579 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT1P21579 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT1P21579 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT1P21579 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT1P21579 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT1P21579 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms