Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms