Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms