Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARF4P18085 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARF4P18085 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARF4P18085 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARF4P18085 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARF4P18085 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARF4P18085 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARF4P18085 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARF4P18085 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARF4P18085 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARF4P18085 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARF4P18085 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARF4P18085 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARF4P18085 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARF4P18085 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARF4P18085 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARF4P18085 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARF4P18085 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARF4P18085 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARF4P18085 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARF4P18085 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARF4P18085 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARF4P18085 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARF4P18085 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARF4P18085 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARF4P18085 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARF4P18085 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARF4P18085 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARF4P18085 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARF4P18085 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARF4P18085 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARF4P18085 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARF4P18085 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARF4P18085 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARF4P18085 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARF4P18085 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARF4P18085 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARF4P18085 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARF4P18085 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARF4P18085 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARF4P18085 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARF4P18085 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARF4P18085 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARF4P18085 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARF4P18085 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARF4P18085 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARF4P18085 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARF4P18085 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARF4P18085 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARF4P18085 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARF4P18085 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARF4P18085 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARF4P18085 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARF4P18085 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARF4P18085 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARF4P18085 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARF4P18085 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARF4P18085 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARF4P18085 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARF4P18085 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARF4P18085 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARF4P18085 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARF4P18085 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARF4P18085 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARF4P18085 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARF4P18085 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARF4P18085 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARF4P18085 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARF4P18085 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARF4P18085 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARF4P18085 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARF4P18085 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARF4P18085 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARF4P18085 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARF4P18085 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARF4P18085 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARF4P18085 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARF4P18085 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARF4P18085 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARF4P18085 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARF4P18085 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARF4P18085 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARF4P18085 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARF4P18085 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARF4P18085 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARF4P18085 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARF4P18085 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARF4P18085 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARF4P18085 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARF4P18085 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARF4P18085 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARF4P18085 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARF4P18085 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARF4P18085 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARF4P18085 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARF4P18085 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARF4P18085 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARF4P18085 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARF4P18085 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARF4P18085 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms