Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS1P17812 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTPS1P17812 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms