Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms