Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
UBTFP17480 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
UBTFP17480 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
UBTFP17480 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
UBTFP17480 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
UBTFP17480 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
UBTFP17480 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
UBTFP17480 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
UBTFP17480 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
UBTFP17480 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
UBTFP17480 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
UBTFP17480 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
UBTFP17480 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
UBTFP17480 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
UBTFP17480 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
UBTFP17480 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
UBTFP17480 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
UBTFP17480 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
UBTFP17480 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
UBTFP17480 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
UBTFP17480 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
UBTFP17480 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
UBTFP17480 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
UBTFP17480 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
UBTFP17480 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
UBTFP17480 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
UBTFP17480 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
UBTFP17480 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
UBTFP17480 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
UBTFP17480 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
UBTFP17480 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
UBTFP17480 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
UBTFP17480 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
UBTFP17480 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
UBTFP17480 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
UBTFP17480 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
UBTFP17480 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
UBTFP17480 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
UBTFP17480 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
UBTFP17480 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
UBTFP17480 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
UBTFP17480 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
UBTFP17480 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
UBTFP17480 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
UBTFP17480 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
UBTFP17480 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
UBTFP17480 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
UBTFP17480 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
UBTFP17480 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
UBTFP17480 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
UBTFP17480 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
UBTFP17480 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
UBTFP17480 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
UBTFP17480 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
UBTFP17480 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
UBTFP17480 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
UBTFP17480 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
UBTFP17480 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
UBTFP17480 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
UBTFP17480 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
UBTFP17480 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
UBTFP17480 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
UBTFP17480 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
UBTFP17480 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
UBTFP17480 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
UBTFP17480 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
UBTFP17480 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
UBTFP17480 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
UBTFP17480 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
UBTFP17480 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
UBTFP17480 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
UBTFP17480 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
UBTFP17480 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
UBTFP17480 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC33.82■■■■□ 3
UBTFP17480 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
UBTFP17480 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
UBTFP17480 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
UBTFP17480 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
UBTFP17480 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
UBTFP17480 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
UBTFP17480 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
UBTFP17480 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
UBTFP17480 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
UBTFP17480 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
UBTFP17480 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
UBTFP17480 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
UBTFP17480 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
UBTFP17480 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
UBTFP17480 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
UBTFP17480 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
UBTFP17480 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
UBTFP17480 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
UBTFP17480 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
UBTFP17480 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
UBTFP17480 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
UBTFP17480 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
UBTFP17480 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
UBTFP17480 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
UBTFP17480 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
UBTFP17480 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms