Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD1P17405 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms