Protein–RNA interactions for Protein: P17081

RHOQ, Rho-related GTP-binding protein RhoQ, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOQP17081 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOQP17081 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOQP17081 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOQP17081 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOQP17081 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOQP17081 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOQP17081 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOQP17081 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOQP17081 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOQP17081 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOQP17081 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOQP17081 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOQP17081 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOQP17081 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOQP17081 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOQP17081 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOQP17081 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOQP17081 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOQP17081 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOQP17081 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOQP17081 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOQP17081 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOQP17081 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOQP17081 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOQP17081 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOQP17081 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOQP17081 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOQP17081 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOQP17081 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOQP17081 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOQP17081 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOQP17081 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOQP17081 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOQP17081 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOQP17081 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOQP17081 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOQP17081 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOQP17081 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOQP17081 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOQP17081 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOQP17081 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOQP17081 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOQP17081 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOQP17081 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOQP17081 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOQP17081 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOQP17081 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOQP17081 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOQP17081 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOQP17081 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOQP17081 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOQP17081 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOQP17081 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOQP17081 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOQP17081 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOQP17081 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOQP17081 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOQP17081 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOQP17081 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOQP17081 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOQP17081 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOQP17081 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOQP17081 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOQP17081 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOQP17081 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOQP17081 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOQP17081 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOQP17081 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOQP17081 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOQP17081 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOQP17081 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOQP17081 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOQP17081 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOQP17081 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOQP17081 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOQP17081 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOQP17081 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOQP17081 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOQP17081 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOQP17081 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOQP17081 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOQP17081 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOQP17081 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOQP17081 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOQP17081 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOQP17081 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOQP17081 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOQP17081 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOQP17081 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOQP17081 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOQP17081 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOQP17081 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOQP17081 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOQP17081 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOQP17081 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOQP17081 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOQP17081 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOQP17081 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOQP17081 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOQP17081 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms