Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms