Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCP1P13796 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCP1P13796 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCP1P13796 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCP1P13796 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCP1P13796 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCP1P13796 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCP1P13796 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCP1P13796 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCP1P13796 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCP1P13796 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCP1P13796 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCP1P13796 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCP1P13796 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCP1P13796 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LCP1P13796 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCP1P13796 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCP1P13796 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCP1P13796 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCP1P13796 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCP1P13796 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCP1P13796 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCP1P13796 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCP1P13796 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCP1P13796 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCP1P13796 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCP1P13796 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCP1P13796 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCP1P13796 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCP1P13796 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCP1P13796 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCP1P13796 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCP1P13796 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LCP1P13796 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCP1P13796 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCP1P13796 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCP1P13796 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCP1P13796 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCP1P13796 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCP1P13796 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCP1P13796 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCP1P13796 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCP1P13796 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCP1P13796 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCP1P13796 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LCP1P13796 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCP1P13796 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCP1P13796 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCP1P13796 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCP1P13796 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LCP1P13796 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCP1P13796 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCP1P13796 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCP1P13796 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCP1P13796 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCP1P13796 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCP1P13796 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCP1P13796 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCP1P13796 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCP1P13796 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCP1P13796 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCP1P13796 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCP1P13796 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCP1P13796 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCP1P13796 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCP1P13796 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCP1P13796 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCP1P13796 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCP1P13796 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCP1P13796 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LCP1P13796 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCP1P13796 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LCP1P13796 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCP1P13796 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LCP1P13796 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCP1P13796 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LCP1P13796 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCP1P13796 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LCP1P13796 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCP1P13796 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LCP1P13796 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LCP1P13796 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LCP1P13796 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCP1P13796 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LCP1P13796 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCP1P13796 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCP1P13796 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCP1P13796 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LCP1P13796 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCP1P13796 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCP1P13796 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCP1P13796 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCP1P13796 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCP1P13796 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCP1P13796 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCP1P13796 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCP1P13796 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCP1P13796 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LCP1P13796 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCP1P13796 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms