Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCG2P13521 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCG2P13521 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCG2P13521 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCG2P13521 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCG2P13521 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCG2P13521 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCG2P13521 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCG2P13521 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCG2P13521 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCG2P13521 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCG2P13521 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG2P13521 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG2P13521 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG2P13521 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG2P13521 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG2P13521 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG2P13521 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG2P13521 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG2P13521 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG2P13521 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG2P13521 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG2P13521 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG2P13521 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG2P13521 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG2P13521 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG2P13521 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCG2P13521 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG2P13521 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG2P13521 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG2P13521 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG2P13521 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG2P13521 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG2P13521 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG2P13521 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG2P13521 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG2P13521 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG2P13521 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG2P13521 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG2P13521 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG2P13521 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG2P13521 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG2P13521 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG2P13521 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG2P13521 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCG2P13521 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCG2P13521 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCG2P13521 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCG2P13521 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCG2P13521 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCG2P13521 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCG2P13521 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCG2P13521 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCG2P13521 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCG2P13521 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCG2P13521 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCG2P13521 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCG2P13521 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCG2P13521 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCG2P13521 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCG2P13521 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCG2P13521 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SCG2P13521 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCG2P13521 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCG2P13521 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCG2P13521 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCG2P13521 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCG2P13521 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCG2P13521 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG2P13521 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG2P13521 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG2P13521 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG2P13521 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG2P13521 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG2P13521 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG2P13521 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG2P13521 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG2P13521 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG2P13521 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG2P13521 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG2P13521 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCG2P13521 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCG2P13521 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCG2P13521 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCG2P13521 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCG2P13521 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCG2P13521 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCG2P13521 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCG2P13521 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCG2P13521 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCG2P13521 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCG2P13521 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCG2P13521 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCG2P13521 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCG2P13521 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCG2P13521 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCG2P13521 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCG2P13521 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCG2P13521 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCG2P13521 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms