Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD8P13378 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms