Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYL4P12829 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYL4P12829 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYL4P12829 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYL4P12829 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYL4P12829 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYL4P12829 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYL4P12829 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MYL4P12829 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYL4P12829 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYL4P12829 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYL4P12829 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYL4P12829 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYL4P12829 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYL4P12829 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYL4P12829 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYL4P12829 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYL4P12829 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYL4P12829 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYL4P12829 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYL4P12829 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYL4P12829 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYL4P12829 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYL4P12829 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MYL4P12829 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MYL4P12829 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYL4P12829 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYL4P12829 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYL4P12829 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYL4P12829 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MYL4P12829 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MYL4P12829 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYL4P12829 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MYL4P12829 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYL4P12829 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYL4P12829 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYL4P12829 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYL4P12829 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYL4P12829 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYL4P12829 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYL4P12829 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYL4P12829 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYL4P12829 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYL4P12829 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYL4P12829 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYL4P12829 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYL4P12829 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYL4P12829 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYL4P12829 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYL4P12829 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYL4P12829 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYL4P12829 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYL4P12829 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYL4P12829 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MYL4P12829 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYL4P12829 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYL4P12829 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYL4P12829 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYL4P12829 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYL4P12829 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYL4P12829 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYL4P12829 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYL4P12829 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYL4P12829 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYL4P12829 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MYL4P12829 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYL4P12829 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYL4P12829 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYL4P12829 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MYL4P12829 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYL4P12829 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYL4P12829 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYL4P12829 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYL4P12829 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYL4P12829 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYL4P12829 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MYL4P12829 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYL4P12829 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYL4P12829 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYL4P12829 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYL4P12829 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYL4P12829 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYL4P12829 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYL4P12829 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYL4P12829 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYL4P12829 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYL4P12829 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYL4P12829 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYL4P12829 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYL4P12829 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYL4P12829 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYL4P12829 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYL4P12829 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYL4P12829 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MYL4P12829 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MYL4P12829 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYL4P12829 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MYL4P12829 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYL4P12829 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYL4P12829 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms