Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN1P12814 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.7 ms