Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI4P10075 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI4P10075 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI4P10075 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI4P10075 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI4P10075 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI4P10075 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI4P10075 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI4P10075 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI4P10075 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI4P10075 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI4P10075 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI4P10075 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI4P10075 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI4P10075 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI4P10075 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI4P10075 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI4P10075 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI4P10075 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI4P10075 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI4P10075 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI4P10075 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI4P10075 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI4P10075 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI4P10075 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI4P10075 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI4P10075 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI4P10075 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI4P10075 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI4P10075 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI4P10075 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI4P10075 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI4P10075 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI4P10075 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI4P10075 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI4P10075 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI4P10075 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI4P10075 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI4P10075 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI4P10075 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI4P10075 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI4P10075 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI4P10075 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI4P10075 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI4P10075 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI4P10075 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI4P10075 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI4P10075 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI4P10075 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI4P10075 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI4P10075 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI4P10075 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI4P10075 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI4P10075 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI4P10075 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI4P10075 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI4P10075 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI4P10075 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI4P10075 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI4P10075 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI4P10075 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI4P10075 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI4P10075 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI4P10075 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI4P10075 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI4P10075 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI4P10075 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI4P10075 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI4P10075 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI4P10075 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI4P10075 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI4P10075 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI4P10075 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI4P10075 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI4P10075 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI4P10075 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI4P10075 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI4P10075 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI4P10075 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GLI4P10075 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GLI4P10075 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GLI4P10075 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GLI4P10075 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GLI4P10075 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GLI4P10075 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GLI4P10075 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GLI4P10075 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GLI4P10075 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GLI4P10075 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GLI4P10075 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GLI4P10075 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GLI4P10075 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GLI4P10075 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GLI4P10075 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GLI4P10075 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GLI4P10075 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GLI4P10075 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GLI4P10075 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GLI4P10075 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GLI4P10075 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms