Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HKR1P10072 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HKR1P10072 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HKR1P10072 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HKR1P10072 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HKR1P10072 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HKR1P10072 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HKR1P10072 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HKR1P10072 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HKR1P10072 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HKR1P10072 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HKR1P10072 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HKR1P10072 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HKR1P10072 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HKR1P10072 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HKR1P10072 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HKR1P10072 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HKR1P10072 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HKR1P10072 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HKR1P10072 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HKR1P10072 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HKR1P10072 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HKR1P10072 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HKR1P10072 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HKR1P10072 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HKR1P10072 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HKR1P10072 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HKR1P10072 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HKR1P10072 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HKR1P10072 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HKR1P10072 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HKR1P10072 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HKR1P10072 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HKR1P10072 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HKR1P10072 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HKR1P10072 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HKR1P10072 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HKR1P10072 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HKR1P10072 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HKR1P10072 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HKR1P10072 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HKR1P10072 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HKR1P10072 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HKR1P10072 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HKR1P10072 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HKR1P10072 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms