Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms