Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAA2P0DJI9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms