Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC2BP0DI82 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms